2.5.2. Хербициди

Прилагат се за унищожаване на нежелани растения или „плевели“. Повечето водят до загиването на всички растения, до които се докоснат, но някои са създадени да действат целенасочено на един определен вид. Добре известен факт е, че употребата на хербициди създава рискове за растителността, заобикаляща дадено обработваемо поле. Хербицидите предизвикват замърсяване на околната среда – въздуха, почвите и водите. Могат да попаднат във водните екосистеми в резултат от поздемния отток и в по-малка степен – от директното приложение и въздушното пръскане. Микробните съобщества в сладководните екосистеми не са пряка мишена, но биват изложени на хербициди и могат да бъдат повлияни от тези съединения пряко или косвено.